Это скорее вопрос вообще обновления джумлы. Неважно с какой версии на какую. Тут много зависит от конфигурации существующего сайта, сначала как всегда сделать бэкап всех файлов и базы данных и потом уже думать как обновить. Новый движок так же дружит с компонентами как и новая джумла...
Простая перезаливка сверху как всегда в таких случаях - на свой страх и риск, как и если бы вы просто перезалили новую версию Joomla сверху старой.
Уровень сложности равен простому обновлению сайта до последней версии + установить пару компонентов. В таких случаях стоит начинать обновлять сайт на Joomla если вы точно уверены в том, что сможете вернуть все на место, как минимум. Это касается не только данной сборки - а и любого обновления версий движка.
Я бы наверно при наличии уже установленных компонентов делал бы так (это вариант - "с места в карьер"

:
1. Сделать бэкап базы данных самого сайта.
2. Просто загрузить файлы новой джумлы поверх старых, предварительно удалив из пакета инсталляции папки компонентов Артио, карты сайта, компонента обмена ссылками и акселератора:
com_sef,
com_xmap,
com_jvlinx,
com_joomlacache. Эти папки находятся и в двух папках –
/components/ и
/administrator/components/.
3. Эти компоненты, которые удалены были из сборки потом можно скачать отдельно тут же на сайте и установить отдельно как простые компоненты.
4. Протестировать сайт внимательно и посмотреть, какие глюки и проблемы возникли (елси возникли) и исправить их.
Это и есть по сути стандартное, обновление сайта на последнюю стабильную версию Joomla 10.0.13 со всеми SEO-изменениями в файлах.
Еще раз оговорюсь, что такого рода вещи (обновление Joomla, неJoomla, крупных скриптов форумов и тп) стоит делать как минимум если вы уверены что сможите вернуть все на место и понимаете, что вы делаете.